2010-07-03から1日間の記事一覧

BLASTの結果をSAM形式に変換するスクリプト

BLAST(blastn)の結果を次世代シークエンサで使われるSAM形式に変換するスクリプトです.SAM toolsの中にも,blast2sam.plというperlスクリプトがあり,これのruby移植です. 少し拡張してあって,SAM toolsのblast2sam.plだと配列やquarity valueを出してく…