2007-05-01から1ヶ月間の記事一覧

えきあど

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JR東京駅丸の内北口から出て八重洲北口への通路の入り口あたりに,ちいさなコインロッカーの様なものがある. http://www.eki-ad.com/top.html 私書箱らしい.Suicaが鍵・・・.近くにオフィス or 家があったり,通勤経路なら,便利かも?

エクセルの条件付き書式設定

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エクセルには条件付き書式設定という,条件に当てはまったセルの書式(背景色やフォントなど)を変更する機能(書式ー条件付き書式設定)があるが,条件が3つまでしか入力できない.まったく使えない.

Ruby で Mann-Whitney U test をする

Rubyで順位検定のマン- ホイットニーのU検定をするプログラムを書いて見ました. 教科書に出てくる平均や分散の近似式で計算しています(配列の長さを n1, n2とすると,平均 n1*n2/2, 分散 sqrt(n1*n2 * (n1+n2-1)/12) このため,順位が同じものが非常に多い…

論文を読む日

午前中会議の後は,ひさびさに,論文をさがし,じっくり読む日でした.また,色々な人の近況を見つつ,自分の研究スタイルを考えたり,迷ったり,考えたり.

所属の多い論文

Genome-wide association study identifies novel breast cancer susceptibility loci http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature05887.html 共著者の数だけではなく,共著者の所属の数が多い!147箇所!?

石浦章一先生の講義録本2冊

東大の教養学部で行われている石浦先生の講義録.遺伝子の話から脳の高次機能の話まで幅広く,一般的に面白いトピックに絞って平易に書かれている.あまり生命科学について知らない人が聴講した場合でも,興味があれば十分楽しく読み,蘊蓄を増やすことがで…

競争的研究,網羅的研究

ここ数日,現状の仕事(かならずしも研究だけではない)の状況と照らし合わせて,いろいろ考えさせられる文章に出会うことが多かった.感想を書こうとすると,賛同の意見,反対意見と共に,愚痴の様なものが口をついて(キーボードをついて)出てくるので,リ…

Mac mini の販売が終了される?

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まぢ?1台買っとこうかな・・・.http://www.kodawarisan.com/k2007_01/archives/2007/05/mac_mini_aeacae.html

DB Magazine 7月号の見本誌

2ページほど寄稿させていただいたDB Magazineの見本紙が届きました.明日発売かな. 自分の記事を開いた瞬間,誤字を発見したのは秘密です.orz.

過去2週間分のビジネス英会話が聞ける

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「この音声配信は、ダウンロードできません。ご了承ください。」と注意書きがあるが,過去6回(2週間分)の内容がアップされてて明示的に聞ける(なんか,奥歯に物の挟まったような言い回し). http://www.nhk.or.jp/gogaku/english/business/index.html い…

キーボードっていい!と思える101のショートカット

http://www.dumblittleman.com/2007/05/productivity-ninja-101-ways-to-rock.html Firefox で "/"を打つとQuick Findが開くって知りませんでした.他にも案外知らないのがある.

SQLite の JDBC ドライバ

SQLiteをJavaから叩くJDBCドライバが,http://www.zentus.com/sqlitejdbc/ から入手できる. Mac版(jnlibを利用したもの)やWindows版(dllを利用したもの)もあるが,Pure Javaのを試す. sqlitejdbc-v033-nested.jar にライブラリパスを通した後(Eclipse な…

セミナー

久々に機械学習系の話を聞いて楽しかった.アカデミックな雰囲気で元気が出る. また,自分自身は,方法論だけじゃなくて,意味ある(生命科学的に意味のある,実生活に役立つ,など)結果が出ることに興味が強いことを再認識.

キャリア応援マガジン「インキュビーベータ(incu-beβ)」

バイオ教育用キットを売っているリバネスが,研究者の卵向けフリーペーパーを創刊するそうです. http://2007.leaveanest.com/incu-be/beta/ 創刊号は遺伝研特集.

コーヒーマシン・センセオ(Senseo)

http://www.senseo.com/jp/SenseoJP 利用できるYahoo!ポイントがあったので,買ってみた.1週間位使ったので雑感 1杯のコーヒーがそれなりの味で楽しめる エスプレッソではなく,あくまでコーヒーと思うべし. コーヒーメーカで1杯でつくるよりはおいしい 1…

DB Magazineの原稿

翔泳社DB Magazine http://www.seshop.com/share/category.asp?cid=2542 の2007年7月号に2ページほど寄稿させていただきました.増永先生@青学の連載されている研究紹介の項目です.5月24日発売だそうです.内容は2006年11月のJSBi・Systems Biology研究会(…

TIBCOのSpotfire 買収

遅ればせながら, http://bonohu.jp/t/20070509.html#p01 で,Microarrayデータの解析でも利用されるデータマイニングソフトウエアSpotfireを作るSpotfire社が買収されるのを知る. "TIBCO and Spotfire" http://www.tibco.com/company/spotfire/default.jsp…

ごー!

ラストスパートであります・・・が,首根っこ捕まれて,妨害されました.何とか妨害を振り切りました.

fireburgerのポテト

気合い入れに,fireburger. http://d.hatena.ne.jp/sesejun/20070328/p2 http://palstage.blog.ocn.ne.jp/palog/2007/03/fireburger_0703.html コンボのポテトは50g, 単品でポテトを頼むと100gみたいです. コンボ=ハンバーガー+ポテト+ドリンクの値段と…

バイオインフォマティクスイベントのGoogle Calndar

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bionet-software に流れていました.http://www.bioinformatics.fr/events.php このアドレスに投稿されているイベントが,google calndar に 登録されています. 上記のページの google calendar のボタンを押せば,自分のカレンダーに追加できます.

科学技術社会論学会シンポジウム 科学研究における「不正」の構造

http://jssts.org/content/view/93/31/ 日程・時間: 6月2日(土)13:00〜17:30 場所: お茶の水女子大学 理学部3号館 7階 あ,隣の部屋だ.有名人多いし,覗きに行こうかな. 皆さん,シンポジウム終わったら張った案内板はちゃんと剥がして下さいねー (…

AM, PM+12時間表示で時間が指定できる時間選択を作りたい

http://d.hatena.ne.jp/sesejun/20070505/p1 の続き.railsの話.時刻の指定でAMやPMを入れたいという場合, date_helperのselect_hourではAM. PMの指定に対応していないようです. ここでは,DateHelperのクラスを拡張します.利用するcontrollerがreserves…

datetime_select より詳細に日付を指定したい

datetime_select は,日付,時間を利用するのに便利な html_helperです. どのようなオプションが利用できるか,マニュアルを見ても分かりにくいですが, datetime_selectは,select_day, select_hourなどを順番に呼んでいるだけなので, selct_* のオプショ…

BioRubyのドキュメントって,どこ?

今現在,どこにまとまったリンクがあるのだろう?Wiki (http://dev.bioruby.org/wiki/en/)のtutorial.rb かな?ちょっと古いのが気になる.探し方が悪いだけかな・・・.BioPerlだと,http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page の Getting Started とか Advanc…

XmlSimple (ruby) を使ってみる

PerlのXML::Simple のruby port であるxml-simple(http://xml-simple.rubyforge.org/)を使ってみる.XMLを(連想)配列にマップしてくれます. インストール gem install xml-simple 使い方 説明のサンプルは,http://xml-simple.rubyforge.org/ より. requ…

Rubyの配列(Arrayクラス)を拡張して和,分散,標準偏差,相関係数を計算する

多分誰かが行っているので,車輪の再開発だとは思いますが・・・. http://raa.ruby-lang.org/project/math-statistics/ にあるので完全に車輪の再開発ですが,ちょっと機能も加わっています(減ってもいます).nakaoさん,情報ありがとうございました. オ…

KEGGのXMLを少し調べてみた

NM番号の付いた遺伝子をKEGGにmapしたかったので調べたメモ. データの在処 ftp.genome.ad.jp:/pub/kegg/ PathwayのXML xml/map/ reference pathwayのもの ファイル名は "map" + $pathway_id + ".xml" xml/ko/ reference pathway(KO)のもの XML上のmapとの違…

申請書

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捺印が無かったらしい.ごめんなさい!>担当者様