2007-01-01から1ヶ月間の記事一覧

亀の歩み

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でしか,仕事は進みません.でも,着実に前に進んでいると信じたい.

JRubyのインタビューにあるNetBeans Rubyのスクリーンショットがやばい

Sunに居るJRuby開発者 Tor Norbye と Martin Krauskopf のインタビューがだが,4ページ目ではNetBeans(Eclipse対抗のSunが支援するIDE)のRubyモジュールのスクリーンショットが公開されている.Rubyは型付けが動的なので,IDEを作るのが容易ではないと思うが…

An Introduction to Information Retrieval

http://nais.to/~yto/clog/2007-01-23-5.html http://www-csli.stanford.edu/~schuetze/information-retrieval-book.html Christopher D. Manning, Prabhakar Raghavan and Hinrich Schützeという,素晴らしいメンバーによる本.Raghavanはデータマイニング…

KEGG APIが刺さる

KEGG APIのcolor_pathway_by_objectsとget_html_of_colored_pathway_by_objects を使って,Pathway上の遺伝子に色を付けようとしていたのだが,次の2つの条件で全くレスポンスが貰えなくなる. 遺伝子(kegg id)の数と,指定した色の数が違う時 入力した遺伝…

16GB

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rubyスクリプトでメモリ16GB使っているって,一体(汗)

メソッドの動的な呼び出し

obj のメソッド func を呼び出すには, obj.func # 普通 obj.__send__:func # シンボル obj.__send__"func" # 文字列 とかできるんだな.ふむふむ. http://www.loveruby.net/ja/ruby/method.html http://namikilab.tuat.ac.jp/~sasada/prog/rb1.html

変数名を動的にして値の設定(インスタンス変数限定)

objメソッドのインスタンス変数一覧は obj.instance_variablesで得られる. objのインスタンス変数@varの値は,obj.instance_variable_get(:@var)で得られる("@var"もOK) objのインスタンス変数@varの値の変更は,obj.instance_varable_set(:@var, value)で…

痛い

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仕事が終わらず,旧友との飲み会をキャンセル.痛い.

マイクロアレイ解析講習会 - 実験編

http://d.hatena.ne.jp/sesejun/20061215/p1 の実験部分終了.実験に関わってくださった方,ありがとうございました. さーて,解析開始!なにがでるかなー.

Critical Review of Published Microarray Studies for Cancer Outcome and Guidelines on Statistical Analysis and Reporting

http://jnci.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/99/2/147 2004年のマイクロアレイ解析をチェックして問題を指摘した上で,「すべし,すべからず」を50項目挙げている.でも,この50項目,確率とか機械学習が何たるかを知っていれば当然の事ばかり.解…

機能ゲノミクス研究会&ゲノム情報利用WS

http://www.kazusa.or.jp/workshop/genome2007/ おお,ロゴが右下に!もっと上の方でアピールしてもいいのに! 何喋るかなー

WEBrickの再起動無しでクラスを読み込ませる

railsで,自分で作成したクラス(Cとする)をControllerから読み出していたら,Cを変更しても,Webrickを再起動しないと,変更を認識してくれない.変更の度に再起動は面倒だなー,と思っていたところ, http://wota.jp/ac/?date=20060307#p01より, include R…

アイリスオーヤマ、がん検診事業に参入へ

etc

なぜ,アイリスオーヤマが,PET, MRT, CTなどを入れた総合的な検診センターを造るのだろう? http://www.nikkei.co.jp/news/sangyo/20070111AT1D110B111012007.html

macFUSE - Mac用のFUSE - が google code blog でリリース

一時期GMailをファイルシステムとして活用しよう!なんてプロジェクトがありましたが,その手のプログラム(Web Pageなどをファイルシステムとしてマウントするプログラム)をユーザ権限で作成出来るようにするFUSEのMac版. http://google-code-updates.blo…

PLoS One - Research 2.0 ?

新しいジャーナルが創刊したようです.ちょっと変わっていて,内容の主観的な面白さ以上に,内容の正しさを評価して,掲載を決めます.そして掲載を決めた後は, If published, papers will be made available for community-based open peer review involvi…

TV

etc

別に,apple TVの話ではありません. RSSを見ていたら,今日は2つ程見たい番組があったが,いずれも録画を忘れた事に気付いた.orz.あまり見たいTV番組なんて,ないんだけど,集中するときは,集中するなぁ.

[rails] テストモードではDBへの書き込みがロールバックされる

ロールバックされていることに気付かず,DBに反映されないなーと,小一時間悩みましたとさ. テスト用DBを使いつつ,ロールバックしないようにするには,どうしたら良いのかなー? 一連のDBに書き込みをした後,データが正しいか,あれこれ調べたいのだけど…

hamachiがいい! - 家のiTunesライブラリを職場で聞こう

hamachi (http://www.hamachi.cc/) は,設定が超楽なVPNソフト.softetherとかOpenVPNとかの類いといえば良いだろうか.特徴として 設定は(特にWindows版では)メッセンジャーやiChatを設定する手間+αくらい. Mac, Linux, WindowsのどのOSでも動くのが嬉し…

多比良先生のインタビュー動画

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立花ゼミ,Sciから.YouTubeに(公的に)あがってます・・・ http://sci.gr.jp/project/figment/movie.php

Word腐ってる

etc

落ちまくり.

railsで定義したモデルをrailsのディレクトリの外から使う.

メモ.$RAILS_DIR が railsのディレクトリ(rails demoとしたら,demoのディレクトリ)とすると, ENV['RAILS_ENV'] = ARGV.first || ENV['RAILS_ENV'] || 'development' require '$RAILS_DIR/config/boot' require "#{RAILS_ROOT}/config/environment" requir…

メモリが足りねー

2GBあるのに orz.Eclipseは立ち上げてないので,Parallels と Firefoxのせいだなー.あと,HDDアクセス(シーク速度),もっと速くならないかな.

GMail のPOPが終わった

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やっと終わった.計5万通強.Thunderbird2.0beta1でセコセコPOPした.Thunderbirdの検索,5万通もあるのにサクッとできて,快適だな.

script/console

script/console なるものがあることを知る.irbな状態でrailsのデバッグ可能.Agile Web Development with Railsの13.7章. % ./script/console Loading development environment. >> irb helper >> puts options_for_select([["a",1],["b",2],["c",3]],[1]) <option value="1" selected="selected"></option>…

恒例の NAR DB Issue

http://nar.oxfordjournals.org/content/vol35/suppl_1/index.dtl 現時点で,トップページからリンクはないんだけど,見られるみたい? データベースが多く成りすぎて,意味不明になりつつある. 気になったものを,ざっくりと,はてぶに放り込みました.htt…

東京の夜景

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東京タワーはコウコウと照るが,ヒルズのビルは暗い.東京の夜景は,オフィスの灯で出来てるんだなー.

gmailのPOPは,300通ずつ?

POPして,バックアップ取ろうと思ったら,1度に300通前後しかPOPできません. 仕様?全部で,3万通あるので,100回クリッククリック.たるー.

Bootcamp + Parallels WS

mac

BootcampでインストールしたWindowsをParallels Workstation (Build 3000番台以降)から起動できるというので,友人に勧めたら,早速インストールし,快適だと言われたので,自分でも入れてみる.(弱.因に,実際インストールしたのは昨年末) Bootcamp-1.1.…

あけましておめでとうございます

etc

です.