GO Annotation Camp 3rd day

  • 6/5 追記
  • 人によって特にevidenceの判断が分かれる論文のGO annotation. MGIのマウスの人は、個々の遺伝子は調べられているものも多いので、sequence similarityによるevidence(ISS)は厳格に判断するので、under calling な内容になっているみたいだ。一方、今まで近縁種も遺伝子もあまり調べられていない種は、sequence similarityをannotatioに入れないと、GOとの対応の取れる遺伝子が現状少なくなってしまうので、しっかりとした内容なら、sequence similarityを考慮したいという主張。
  • (もしかしたら4日目の話かも)GOに関するリクエスト(新しいtermの追加など)は、Sourceforgeのtrackerから投げればよいとのこと。また、このtrackerに追加した際に、関係者に投げられるメールは、チケットのタイトルのみしか表示しないので、○○ - new term request などと、新規のtermの追加変更など明確にして、書いてほしいとのこと。http://sourceforge.net/tracker/?func=browse&group_id=36855&atid=440764