GOのデータベースをPostgreSQLで作る
GO(http://www.geneontology/org)のデータベースはMySQL形式が公開されていますが,
PostgreSQLでは,そのままでは動かないので,テーブル作成のSQLやデータを入れるスクリプトをまとめて,
「http://www.se-se.jp/doc/go-postgres.html(http://www.se-se.jp/doc/go-postgres.html)」 に置きました.
テーブルの構成など変更していないので,
MySQLの独自拡張部分などを除き,http://www.godatabase.org/dev/sql/doc/example-queries.htmlのサンプルが使えます.
これを作っているときに,MacBook Pro上のPostgreSQLが異常に遅いことに気付きました.ディスクが遅いからかなぁ.それとも,何かチューニングを忘れているのでしょうか?インストールは,darwinportsから,
port install postgres8 +server
として,最後に出てくるメッセージ(initdbなど)を実行しただけなのですが・・・.