読みました。日本語で、Googleを支える技術（特に分散処理）の部分をここまで丁寧に書かれた本は無いので、分散処理、ペタバイト級の大規模データ処理などに興味がある人、今の（というか、おそらく少し前の）googleに興味ある人は必読。いわゆるハイパフォ…
列挙系のアルゴリズム(全順列を列挙するとか、データマイニングではAprioriとか）の紹介合宿？のスライドが掲載されている。最近のデータの肥大化から完全な列挙は難しい状況にはあるが、今までの列挙を俯瞰するにはとても良いスライド。 http://keisan-genk…
週末から今日にかけて、年度末の挨拶として何件か訪問者。赴任してからお世話になっていた方などが去り、寂しくなるなぁ。お世話になりました。m(__)m
Mac では、Leopardから国語辞典（大辞泉）、英和・和英辞典（プログレッシブ）、類語辞典（類語例解辞典）が入っています。２万円しないOSに辞書まで入っているなんて、便利。 また、日本語環境でインストールすると、デフォルトでは検索がオフになっていま…
zsh ログインシェルをmacportsのzsh-develにする。 port install zsh-devel でインストールした後 /etc/shells に、/opt/local/bin/zsh を入れて、chsh samba 設定位置が違ってはまる。(普通のLeopardの様に「共有」ではない) applications/servers/サーバ管…
OS X Serverをデスクトップとして利用してみようとおもふ。 インストールログ Firefox addon FireGestures https://addons.mozilla.org/ja/firefox/addon/6366 FireBug http://www.getfirebug.com/ WebDeveloper https://addons.mozilla.org/en-US/firefox/a…
一段落して、今日から、いろいろスタート。
先月、学会に行っていました。日本人の学生がほとんどいない。見る顔は、教員レベルの人ばかり。 生物な方からは、「バイオインフォって就職の幅広がるんでしょ？」と言われます 理学だろうか、工学だろうか、薬学だろうか、医学だろうか？ 製薬M&Aは終わっ…
半年悩まされた懸案事項は、進めてみると、更なる問題点があることが分かった。心痛む事を強制されている。
「権力者、末期の症状ですね」
半年、悩まされ続けた懸案事項が先に進んだ。有効活用せねば。
周りに話をして、外圧を高めて、仕事をすすめるわけです。
survive できているのか？ 今週で一区切り、そして、次のステップへ。
今年の狙い 研究成果をだす。 楽しい仕事にする 継続性をもって進める 仕事の話ばっかだな・・・ 今年もつたない書き散らしのページですが、よろしくお願いいたします。
今年一年、いろいろお付き合いくださった皆様、ありがとうございました。 年始は平穏な１年かと思っていたのですが、予想外に色々事件の起こった１年でした。 時間の使い方がうまくいかず、研究の進展が芳しくなかったのが、反省点。 また来年も、色々な方に…
MacBookを修理に出した．Apple StoreのGenius Bar(サポートセンターみたいなところ？)に持っていき， 症状を言ったら以下のことを行ってくれた． 外付けHDDからの起動 無事起動．メモリ，液晶，マザーボードは正常に動いている事が確認できる．ディスクがあ…
12/18, AM11:17 図もクリックできるように追記． タグはrailsだけど，単にjavasctipt(prototype)+htmlの話． 表にある"term2"をクリックしたら，下の様に図と表をハイライトさせるようにする(term1, term3も同様に機能する)． 図の準備． 角丸3つが書かれた…
ただいま絶賛実験中．目的はMacOSXでクラスタを組むこと(本当はLinuxで組みたいんだけど，管理者のスキル等々の都合も有るのと，MacのノートPCを演算ノードに使いたいので)．そのままでは使い物にならない状態だけど，とりあえず起動できたので，報告．もし…
GraphVizを，rubyからあつかいませう． graphvizのインストール(下記はmacportsの例) sudo port install graphviz rubygemsで ruby-graphviz をインストール sudo gem install ruby-graphviz --remote サンプルプログラムを動かしてみる 以下をsample01.rb …
ちょっとPCをぶんまわしたので，計算時間をメモ．プログラムは，ファイルからデータを読み込んだら，ひたすら数値計算をするもの．データはHashに格納していて呼び出す感じ．利用するメモリは80MB位．言語はruby． CPU OS ruby version 実行時間1 実行時間2 …
http://www.moongift.jp/2007/11/mindtouch_deki_wiki/を見て興味が湧いたので， Macにインストールしてみました．とりあえず，動いているみたい・・・ MacPortsでApache2, MySQL, PHP5をセットアップしておく．http://d.hatena.ne.jp/sesejun/20071113/p1 …
Leopardにセットアップしたのでメモ． Apache2，MySQL5, PHP5のインストール % sudo port install apache2 % sudo launchctl load -w /Library/LaunchDaemons/org.macports.apache2.plist % sudo port install mysql5 +server % sudo -u mysql mysql_install…
Mac OS X Tiger(10.4)ではShift jis でデフォルトは書かれていたけど，LeopardからはUTF-8が標準となっている （おかげで，Eclipseでは普通に文字化けする）． このときは，Javacに漢字コードを指定すれば良い(UTF-8のソースの場合) javac -J-Dfile.encoding…
大きな項目ばかりが記事になりますが，ちょっとしたところで使いやすくなったと思うところ． Finderで共有PCがすぐに現れる いちいち「サーバへ接続」が必要なくなった 画面上部のメニューのプルダウンメニューが角丸に． 角が取れて，丸みを帯びている 無線…
ここ3ヶ月の事件を時系列順に並べ替えよ，と言われたら出来ない自信がある． 忘れていることあったら，せっついてください．本当に忘却している可能性大です．
Leopard のインストール中，インストールターゲットのHDDが選択できず，あせった． （インストール先に，なにも現れない） 結局，昔インストールしたまま使ってなかった，Boot Camp 1.1.2Beta が悪さをしていたようだ．手順 Boot Camp を無効にする Boot Cam…
「買ってはいけない」認定します． 良い点 シールとしては，使い勝手が悪くない touchの反応が悪くなるわけではない 悪い点 画面が見づらくなる 好き嫌いがあるでしょうが，グレア処理したようになって，液晶にざらざら・つぶつぶ感が出ます 裏面全体が覆え…
企業就職だけでなく，アカデミアの就職も活性化する，この時期． 1年半前にも紹介した本(http://d.hatena.ne.jp/sesejun/20060406/p2)だけど，今見ても，アカデミアで職を得るのに参考になる本だと思うし，今の自分にとっても，2年前に読んだときと違う視点…
最近，bioinformatics系の解析ではR(http://www.r-project.org)が使われることが多くなっています．書籍も充実してきています（正直，帯に短しタスキに長しな感じの書籍が多い気もするが，成熟の過程では仕方がないだろう）．でも，私はRが好きになれなくて…
PubMed(生命科学系の論文検索サイト：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez)の論文を使って，生命現象（or 遺伝子）の関係（共起）を調べよう！ってことでシンプソン係数の計算を題材にしてみました．シンプソン係数が大きいほど，入力した2遺伝子（2単…
